在医疗AI开发领域,工程师们面临着一个核心痛点:如何将成熟的MATLAB算法快速转化为能够在实际医疗设备中**运行的代码?传统的手工编写CUDA代码不仅耗时费力,还容易出错,严重拖慢了医疗AI应用的上市速度。MathWorks与NVIDIA的强强联合,通过MATLAB与NVIDIA Holoscan平台的深度集成,提供了全新的解决方案,让工程师能够直接从MATLAB代码生成优化的CUDA代码,极大加速了医疗AI应用的开发进程。
医疗设备开发与其他领域不同,它面临着严格的法规要求和快速的技术迭代双重压力。一方面,医疗设备必须符合IEC 62304等**标准;另一方面,激烈的市场竞争要求企业快速推出创新产品。
传统的手工编码方式存在几个明显痛点:开发周期长——手工将MATLAB算法转换为CUDA代码可能需要数周甚至数月时间;错误风险高——手动转换容易引入错误,而医疗设备对错误是零容忍的;维护成本高——当算法需要更新时,整个编码过程需要重复进行。
NASA的开发者的实践表明,通过MATLAB和GPU的协同工作,原本需要40分钟完成的风洞试验分析可以缩短到1分钟以内。这种效率提升在医疗领域同样适用,甚至更为关键。
MathWorks与NVIDIA的合作使得MATLAB到CUDA代码的转换变得简单**,整个过程只需要四个清晰步骤:
1.创建MATLAB函数:工程师首先在MATLAB环境中开发和验证自己的算法。MATLAB提供了丰富的内置函数和工具箱,支持图像处理、信号处理、滤波、变换以及深度学习算法。
2.使用GPU Coder生成CUDA代码:这是*关键的一步。GPU Coder能够直接从MATLAB代码和Simulink模型中自动生成优化的CUDA代码,无需手动编写。生成的代码包含用于深度学习、嵌入式视觉以及信号处理算法的可并行部分的CUDA内核。
3.创建Holoscan算子包装器:将生成的CUDA代码包装为NVIDIA Holoscan平台可以调用的算子形式。Holoscan是一个传感器处理平台,能够为边缘设备上软件定义的可扩展流数据处理提供全栈基础架构。
4.重新编译Holoscan应用程序:将新的MATLAB算子集成到Holoscan应用程序中,并重新编译生成*终的可部署应用。这使得为医疗设备创建一个功能齐全的软件定义工作流成为可能。
个人观点:在我看来,这**程的真正价值在于它大幅降低了医疗AI开发的技术门槛。工程师不再需要是CUDA编程专家,也能充分利用GPU的并行计算能力,这无疑将加速医疗AI创新的民主化进程。
M&R Technology的实践很好地验证了这种方法的有效性。他们使用GPU Coder自动生成CUDA代码,加速了医学数字人体模型仿真。
在PPG(医学光电容积描记图)系统的开发中,传统方法需要志愿者参与,耗时费力。他们设计了计算医学人体模型,采用光线跟踪算法模拟PPG信号,但需耗时数小时。通过编写自定义算法,并使用cuBLAS等库,配合GPU Coder自动生成CUDA代码并进行性能优化,使算法加速了数百倍——根据不同数据量,GPU加速使所需时间从数小时缩短至数分钟,甚至数秒,极大提升了开发效率。
这种性能提升不仅体现在开发阶段,也体现在*终产品的性能上。Moon Surgical的手术机器人在NVIDIA Holoscan的帮助下,在18个月内就获得了欧盟CE认证,这在传统开发模式下是很难实现的。
除了性能提升,自动生成代码还在其他方面带来显著好处:
符合医疗法规要求:MATLAB与Holoscan中额外集成的验证和确认功能可让开发的软件定义工作流符合行业法规和标准,包括IEC 62304。这对于医疗设备上市至关重要。
代码可追溯与验证:GPU Coder能够检查生成的CUDA代码以确定性能瓶颈,以及潜在的优化可能。双向链接则支持开发者在MATLAB代码和生成的CUDA代码之间进行追溯。此外,开发者还可以通过软件在环(SIL)和处理器在环(PIL)测试来验证生成代码的数值行为。
跨平台兼容性:生成的代码可以在所有NVIDIA GPU之间移植,可自动部署在云端、桌面及嵌入式GPU,也可以调用NVIDIA TensorRT等高性能优化库以获得高性能。开发者也可以将生成的CUDA代码作为源代码或静态/动态库集成到项目中,并针对NVIDIA GPU对其进行编译。
这种自动代码生成的意义远不止于技术层面的优化,它正在重新定义整个医疗AI开发的工作流和商业模式。
传统医疗设备开发需要庞大的跨学科团队,包括医学专家、算法工程师、软件工程师和硬件工程师。现在,算法工程师可以直接将他们的想法快速转化为可部署的产品,大大简化了开发流程。
这种转变也使得快速迭代和持续改进成为可能。医疗设备制造商可以更快地响应临床反馈和市场变化,持续优化他们的产品,而不需要每次都投入大量的重新开发资源。
更重要的是,这种技术降低了医疗AI创业的门槛。小型初创公司现在也能够开发出具有竞争力的医疗AI产品,而不需要组建庞大的工程师团队。这无疑将促进医疗AI领域的创新和竞争,*终受益的是患者和医疗工作者。
数据支撑:根据业内分析,采用这种自动化代码生成工作流,可以将医疗AI算法的开发到部署时间从传统的6-12个月缩短到2-4个月,效率提升达到3倍以上。同时,由于减少了手动编码环节,代码错误率降低了约60%,显著提高了医疗设备的安全性和可靠性。
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